讲述了忍者神龟与蝙蝠侠跨时空相遇，他们本都是默默守护正义的使者。然而在铲除罪恶的过程中蝙蝠侠和忍者神龟产生了误解，经过一系列打斗后，解除彼此的误解，共同作战，守护城市的和平以及人们的安全。

本片作为《超人之死》的续集，主要讲述了超人与“毁灭日”这个劲敌战斗死去之后，超人的遗体却意外消失无踪，同时出现了四位超人头衔的竞争者，分别是：超人的DNA制造出的復制超人——小超人、使用自制高科技裝甲的钢铁人——钢铁超人、半人半机械的生化人——机械超人、以及对罪犯毫不留情的神秘氪星人——歼灭者。在卢特公司的新品发布会上，四位超人相继出现在大都会，展开了一场别开生面的超人大混战。所有人似乎都在争夺成为下一代的钢铁英雄。同时这世界依然动荡不安，黑暗势力似乎已经开始在暗处酝酿着什么，一切都只是时间问题……在超人死后的世界，这四位超人在世间的定位到底是什么，又是为何而生，背后又隐藏着怎样的阴谋？……

影片改编自同名漫画，原著漫画讲述一个神秘的跟踪者名叫“缄默”，他似乎打算从远处暗杀蝙蝠侠。故事中有许多客串角色，其中包含了大量的蝙蝠侠反派，还有多位蝙蝠家族的成员以及和蝙蝠侠的老战友，超人。它还探索了蝙蝠侠和猫女之间的暧昧情愫。

曾经罪恶横行的高谭市，自布鲁斯·韦恩（彼得·威勒PeterWeller配音）决定以蝙蝠侠的身份归来后，仿佛终于发生了新的变化。变种人头目双面人被除掉，然而原变种人团伙摇身变成蝙蝠狂热者，以暴力的方式执行着对善恶之行的裁断。因此，蝙蝠侠的法外行为引起广泛争论，甚至惊动白宫，而高谭的新任探长对其存在颇有微词。正值美苏交恶的危机时刻，超人（马克·瓦雷MarkValley配音）卷入战火，蝙蝠侠和这位昔日的战友因理念不同分道扬镳。在此期间，小丑（迈克尔·爱默生MichaelEmerson配音）高调复出，受邀参加某电视节目访问，实则暗藏新的阴谋。为了阻止小丑的破坏，蝙蝠侠和新一代的罗宾突破重重阻隔，杀向对手……

2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。莱昂纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普奥尼尔成功接头，并和忍者神龟莱昂纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳泰罗汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”，忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。

影片故事设定在一片神秘的、危机四伏的土地上，讲述奇幻生物和传奇家族克莱德一家的故事——充满冒险精神的克莱德家内部的分歧可能威胁到他们的一次重要任务。

续作延续前一部的风格，讲述在这座加拿大小镇上，开展了一场盛大的雪橇比赛，弗兰基带着他的团队参赛，而索菲亚则担任舵手，除此之外，还有新的成员加入了这场比赛，包括神秘而自负的扎克、以及扎克的运动员表姐查莉....

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